黑斑病：从叶尖开始发病，叶色变淡，渐向茎蔓延，被害部位的病斑呈褐色水渍状，在潮湿条件下，病斑上出现淡褐霉状物。3月下旬至4月上旬开始危害，雨水多时发病较严重。防治方法：同“灰霉菌”。
干腐病：被害鳞茎呈蜂窝状，基部变青黑色。除冬季外，均可发生，尤以6～8月严重。防治方法：选择排水良好的沙质壤土作种子地;选择无病虫伤痕的种茎作种，种茎储藏前或栽种前，用20%三氯杀螨砜1000～1500倍液浸种10～15分钟。
施肥：贝母是耐肥作物，且生长期短，立春出苗，立夏枯萎，生长旺期只3个月左右，必须施足基肥，才能保证贝母在生长发育过程中所需要的养分，同时也是增产的重要措施。
病毒病：植株染病后叶片呈褐色，变薄，有不明显的斑点。防治方法：选用健壮鳞茎或选用抗病力强的品种，冬、春季清除残枝杂草，加强田间管理;增施磷钾肥，以增强植株抗病力。
炭疽病：发病叶片上先出现浅褐色晕点，逐渐扩大呈棕色圆形或狭长形略有下陷的斑，并有明显的褐色边缘，后期病斑上生有小黑点。危害基部时，在基部和近叶腋处产生棕色纵向条斑，后期病斑缢缩，直至萎缩干枯。4月中旬发生，4月下旬、5月中旬严重。防治方法：清除病株残体杂草，发病期用50%多菌灵每667平方米100g，加中性皂100g，加水120～150千克喷雾。每7～10天1次，连续3次
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