秋季采挖水菖蒲的根茎，除去茎叶及细根，晒干待药用。根茎较粗大，少有分枝，直径1~1.5cm。表面类白色至棕红色。
节间长0.2~1.5cm，上侧有较大的类三角形叶痕，下侧有凹陷的圆点状根痕。质硬，折断面海绵状，类白色或淡棕色，横切面内皮层环明显，有多数小空洞及维管束小点。气较浓烈而特异，味辛。
水菖蒲含α-、β-细辛醚、顺甲基异丁香酚、甲基丁香酚、菖蒲烯二醇）、菖蒲螺烯酮、水菖蒲酮、菖蒲螺酮、菖蒲大牯牛儿酮、菖蒲酮。性温，味辛、苦。开窍，化痰，健胃，醒神。用于癫痫、痰热惊厥、胸腹胀闷、慢性。辛、苦、温。归心、脾、肝经。
石菖蒲栽后生长期注意拔除根部杂草，松土和浇水，切忌干旱。并追施人粪尿2次。以氮肥为主，适当增加磷钾肥，结合喷施新高脂膜增强肥效。并喷施药材根大灵，促使叶面光合作用产物（营养）向根系输送，提高营养转换率和松土能力，使根茎快速膨大，药用含量大大提高。
石菖蒲虫害有稻蝗，为害叶片，可用90%晶体1000倍液防治。并喷施新高脂膜增强防治效果。在秋末要做好越冬防寒保温工作，确保安全越冬，以保来年的丰收。
菖蒲附石用什么石头,石菖蒲怎么养殖?
石头选择：
石料选择上*刻意要求，总体协调即可。
较软的石料如：沙积石.松皮石.芦管石等就制作较为简便且，吸水性好养护简便（打孔不用打穿，靠石料吸水即可）
较硬的石料如：海母石.钟乳石.灵璧石.斧劈石等制作较繁琐，覆植的孔洞需打穿能与盆内水面接触，如用鱼线捆扎根须也要让根系接触盆内水面。
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